זמן הבדיקה מצטמצם במידה ניכרת מכשעה למספר דקות על ידי שיטת ה-RTF-EXPAR החדשה שדווחה המשתמשת בגישה נטולת תמליל הפוך (RTF) להמרה של רנ"א אל תוך ה-DNA ואחריו EXPAR (תגובת הגברה אקספוננציאלית) להגברה בטמפרטורה בודדת.
שליטה בקצב של תקופת הקורונה התפשטות דורשת אסטרטגיית בדיקת וירוסים מדויקת ומהירה יותר. RT-PCR (תגובת שרשרת טרנסקריפטאז פולימראז הפוכה), שיטת הבדיקה המדויקת ביותר המופעלת כיום היא בדיקה דו-שלבית הנמשכת כ-60 דקות לכל דגימה.
החוקרים מאוניברסיטת ברמינגהם דיווחו על שיטה חדשה לזיהוי SARS-CoV-2. זה יכול לאפשר בדיקה הרבה יותר מהירה והוא רגיש מספיק.
זיהוי ה-RNA הנגיפי על ידי RT-PCR (תגובת שרשרת טרנסקריפטאז פולימראז הפוכה) כוללת המרה של RNA ויראלי ל-DNA משלים (cDNA) ואחריו הגברה של cDNA על ידי PCR כמותי (qPCR). לאחר מכן ה-cDNA מזוהה באמצעות צבע ניאון. זה לוקח עד שעה.
זמן הבדיקה מצטמצם במידה ניכרת מכשעה לדקות בודדות על ידי שיטת ה-RTF-EXPAR החדשה שדווחה המשתמשת בגישה נטולת תמליל הפוך (RTF) להמרה של RNA ל-RNA. ה-DNA ואחריו EXPAR (תגובת הגברה אקספוננציאלית) להגברה בטמפרטורה בודדת. ההגברה המתרחשת בטמפרטורה בודדת היא המפתח למהירות, מכיוון שהיא מונעת שלבי חימום וקירור ארוכים של RT-PCR. יתר על כן, קטע ה-DNA המוגבר קטן יותר בהשוואה ל-RT-PCR. לפיכך, EXPAR מייצר עד 108 גדילים של מוצר DNA תוך דקות ספורות. היווצרות הדופלקס מנוטרת, כמו בשיטת RT-PCR באמצעות צבע ניאון, SYBR Green.
מעניין, ניתן לשנות את השיטה החדשה כדי לזהות מספר מחלות זיהומיות אחרות הנגרמות על ידי נגיפי RNA, למשל אבולה, RSV וכו'.
מקור (ים):
קרטר וחב' (2020). זיהוי של תת-5 דקות של SARS-CoV-2 RNA באמצעות תגובת הגברה אקספוננציאלית ללא טרנסקריפטאז הפוכה, RTF-EXPAR. הדפסה מוקדמת. פורסם ב-medRxiv פורסם ב-04 בינואר 2021. DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
***
